3 II du 04/2009 au 07/2013

La deuxième série a été lancée sur le marché en 2009, disponible en version berline trois volumes et cinq portes. Le design est entièrement revu, on retrouve une nouvelle face avant inspirée de celle de la sportive RX-8, de nouveaux feux à dos argenté se détachent à l'arrière. La plate-forme est la même que celle de la génération précédente mais optimisée en ce qui concerne la structure géométrique de la suspension, les dimensions de la voiture sont plus grandes mais le poids a diminué d'environ 10 kg ; contrairement au modèle précédent, cette nouvelle série, en version berline, est également importée en Europe depuis 2010.
La gamme de moteurs s'enrichit d'un nouveau moteur diesel MZR-CD d'une puissance de 150 à 185 chevaux, conçu et produit par Mazda, tandis que les moteurs essence 1,6 MZR et diesel 1,6 MZR-CD restent identiques.
En ce qui concerne les innovations technologiques, la plus importante est l'introduction du système i-stop qui permet à la voiture d'arrêter le moteur lors d'un freinage à basse vitesse et de le redémarrer en seulement 0,35 seconde, permettant une économie de carburant de 12 % par rapport à un moteur traditionnel.